Theo hồ sơ vụ án, ngày 31-12-2014, Hà đang ở nhà (tổ 8, Vĩnh Châu, Vĩnh Hiệp - Nha Trang) cùng với 2 con trai là Nguyễn Đức Thiện, Nguyễn Đức Nhân và cháu gái Lê Hoàng Thiên Nh. (sinh ngày 7-3-2005).

Hà nảy sinh ý định gia‌ּo cấ‌ּu với Nh. nên sai Thiện và Nhân cầm đèn điện ra cho bà Võ Thị Xuân Hoa (là mẹ vợ của Hà), đang bán bánh mì gần nhà. Sau khi Thiện và Nhân đi, Hà gọi cháu Nh. vào phòng, thực hiện hành vi đồ‌ּi bạ‌ּi.

Lúc này, do không thấy Nh. ra quán như mọi ngày nên bà Hoa về tìm và gặp Nh. trên đường. Nh. kể lại mọi chuyện, bà Hoa liền báo cho Lê Hoài Tường Vân (mẹ của Nh.) và bạn của Vân là Nguyễn Thị Tuy Trang hay sự việc.

Ngày 1-1, Trang đưa Nh. đi khám chứng thương và đến cơ quan Công an tố cáo hành vi hiế‌ּp dâ‌ּm của Hà. Tại cơ quan điều tra, Hà nhận toàn bộ hành vi phạm tội như trên và khai đã 2 lần thực hiện hành vi gia‌ּo cấ‌ּu với Nh. vào khoảng tháng 11-2013 và tháng 7-2014 tại nhà riêng.